北京市门头沟区妇幼保健院是一所专事全区妇女、儿童医疗保健工作的北京市二级甲等妇幼保健院，它集管理、保健、医疗、教学，科研功能为一身，是全区妇幼保健工作的管理与技术指导中心。
北京市门头沟区妇幼保健院始终坚持以保健为中心，保健与临床相结合，面向基层、面向群体的妇幼卫生方针，为全区范围内实施《母婴保健法》及《北京市实施中华人民共和国母婴保健法实施办法》提供技术服务、监督与指导。
北京市门头沟区妇幼保健院始终以鲜明的保健特色服务于社会。 1994 — 1997 年间先后指导全区 4 所产科医院创建了爱婴医院，保证院内的母乳喂养率达到 100 ％，行政管理和业务指导全区的产科医院开展了出生缺陷监测、新生儿疾病筛查工作。对新生儿疾病筛查中发现的疾病患儿，妇幼保健院全部给予了追踪管理治疗，有效地提高了门头沟区的出生人口质量。
1997 年以来，北京市门头沟区妇幼保健院对全区 4 所产科医院，进行了助产技术的管理与业务培训，指导他们业务通过了北京市卫生局助产单位评估验收，进一步规范了全区的产科工作，保障了母婴的生命安全。 1999 年，制定了门头沟区孕产妇保健系统管理办法及儿童保健系统管理办法，通过在全区 26 家医疗机构的实施，大大提高了门头沟区的孕产妇、儿童系统管理率，有效地降低了孕产妇、围产儿死亡率。
北京市门头沟区妇幼保健院 ， 建筑面积 2513 平方米，全院设置床位 30 张。设有行政科室、保健部、护理部、医务科、门诊部、信息科、总务科、器械科、病案室、图书室共 13 个职能科室。设有临床一级科室 4 个即：妇科、产科、儿科、预防保健科。设有保健一级科室 5 个即：妇女保健科、儿童保健科、生殖保健科、健康教育科、信息资料科。
北京市门头沟区妇幼保健院设有医技科室 6 个即：药剂科、放射科、检验科、功能检查科、营养科、消毒供应科。拥有全自动生化分析仪、多功能麻醉机、美国 GE B 超机、血细胞分析仪、尿分析仪、输液泵等万元以上的医疗设备 22 台。
北京市门头沟区妇幼保健院现有职工 71 名，其中卫生技术人员 65 名，群体保健人员 12 名，卫生技术人员中具有高级职称 9 名，中级职称 12 名。承担全区的妇女保健、儿童保健、生殖保健、计划生育手术质量的管理与业务技术指导工作。
北京市门头沟区妇幼保健院 1997 年、 1998 年、 1999 年获门头沟区精神文明单位， 1999 年被评为市级“社会用字规范化单位”，获门头沟区 2000-2001 年度两个文明建设百颗星先进集体称号，门头沟区的各项妇幼保健工作受到了市区领导及百姓的好评。